Natri bisulfit được dùng trong phân tích trạng thái ngấm metyl của xitôzin trong ADN.

Trong phương pháp này, natri bisulfit tách nhóm amin ở xitôzin thành uraxin, nhưng không ảnh hưởng đến 5-metylxitôzin, một dạng xitôzin chứa metyl với gốc metyl gắn với cacbon 5.

Khi ADN qua xử lý với natri bisulfit được mở rộng thông qua phản ứng chuỗi polymeraza, uraxin được mở rộng bằng timin và xitôzin chứa gốc metyl được mở rộng bằng xitôzin. Công nghệ sắp xếp ADN hiện được dùng để đọc sự sắp xếp ADN qua xử lý với natri bisulfit. Những xitôzin mà được đọc thành xitôzin sau khi sắp xếp đại diện cho xitôzin chứa gốc metyl, còn những xitôzin mà được đọc thành timin đại diện cho xitôzin không chứa gốc metyl trong ADN gen.[11]